A második évad

A második évad főleg Stacy, férje, Mark és House harcaiból áll. Mark Warner tolókocsiba kényszerült, rehabilitáción kell részt vennie. House-on is elhatalmasodik a gyógyszer iránti vágya, ő is kezelésre szorul. House egyre egyértelműbben udvarol régi kedvesének, Stacynek. Mindezt igyekszik úgy tenni, hogy Markban féltékenységet keltsen. Például az egyik részben, amikor House Stacyéknél van, és Mark nincs otthon, elmegy a vécére, majd az ülőkét szándékosan felhajtva hagyja. House tudomására jut, hogy Stacy pszichológushoz jár, mióta Markot megműtötték, és lábadozik; betör a pszichológiai osztályra és ellopja Stacy aktáit, amelyekből kiderül, hogy Stacy és Mark az utóbbi időben elhidegültek egymástól. Ez újabb erőt ad House-nak az udvarlásra. A két mozgássérült harca a szeretett nő kegyeiért egy újabb humorforrása a sorozatnak. Az évad utolsó harmadára House erőfeszítései sikerrel járnak, sikerül meghódítania Stacyt. Miután együtt töltenek egy éjszakát, a nőben is egyértelművé válik vonzalma House iránt, de érzi, hogy férjének is szüksége van rá. Végül House lesz az, aki kimondja, ha nehezére esik is, hogy nem szeretne kapcsolatot folytatni vele. Stacy ezután felmond a kórháznál, és a sorozatból is eltűnik.

A történet orvosi szálán is folynak az események, a sorozat közepén például egy HIV-fertőzött beteg vére csöppen Cameron szemébe, és fennáll a lehetősége, hogy ő is megfertőződik, azonban a vizsgálat eredménye néhány epizóddal később negatív lesz. Azon az estén Cameron rádöbben, hogy akár meg is halhat, és ezért jelentős mennyiségű alkoholt és drogot vesz magához, és felhívja Chase-t, akivel együtt tölti az estét (és az éjszakát). Chase édesapja meghal rákban, Chase aznap nem tud rendesen figyelni a munkájára, ezért hibát követ el, és a páciens meghal. A hibát az orvosi bizottság vizsgálja, és Chase-t rövid időre felfüggesztik, de ezzel egyidőben House-t is bűnösnek találják, akit – visszaeső lévén – huzamosabb időre lefokoznak, helyettesét Cuddy nevezheti meg, aki Foreman lesz. Az ezt követő néhány részben ő a fődiagnoszta, House pedig Foreman munkáját veszi át, és ezzel Foreman beosztottja lesz. Nem sokkal később Wilson elköltözik a feleségétől, egyenesen House-hoz, ám a társbérlet nem tart sokáig.

Az utolsó részre úgy néz ki, hogy minden visszaáll a régi kerékvágásba, de az epizód azzal kezdődik, hogy egy férfi besétál House irodájába, miközben csapatával éppen egy páciensről beszélgetnek, és lelövi House-t, aki eszméletlenül, vérezve elterül a földön. Ebben a részben tehát House lesz a páciens, az ő életéért küzdenek, de fődiagnoszta nélkül. Eközben House álomképeket lát a saját betegségével kapcsolatban, még álmában is saját magát próbálja diagnosztizálni. Mikor a műtőbe szállítják, House utolsó erejével megkéri Cuddyt, hogy a műtét alatt tegyék ketamin indukálta kómába.